三国两晋南北朝时期，中央司法机关的设置基本沿袭汉制，许多政权仍以廷尉作为最高审判机构，但也有个别政权发生了一些变化。例如：三国时期的吴国曾设置大理。北魏初年，保留鲜卑旧俗，"复置四部大人，坐王庭决辞讼"；太武帝时，"置中都大官、外都大官、都坐大官，皆掌折狱，谓之三都"；入主中原后，仿效魏晋制度，改置廷尉寺。北周则模仿西周制度，设秋官大司寇。特别是北齐改廷尉为大理寺，并扩大机构，增加人员，对后世影响最大。隋、唐、宋三朝均以大理寺为中央审判机关，明、清两代也以大理寺为审判复核机关。